С несовместимостью с x86_64 эта проблема не связана. В списке протестированного железа на сайте
http://www.android-x86.org/
есть ноут Lenovo ThinkPad x61 Tablet, процессор которого x86_64 поддерживает.
Просто дело в том, что проект активно развивается, недоработок много, список поддерживаемых платформ ограничивается, в основном, нетбуками на Intel Atom.